Výskyt flóry se poměrně liší podle celkového charakteru krajiny, počtu srážek a teplot. Bohaté dešťové srážky na severu země umožňují existenci bujné vegetace, rostou zde dubové, bukové a kaštanové lesy, častý je rovněž oleandr, durman, vřesovec a pinie.
Střední část země se vyznačuje stepním charakterem a proto se zde pěstují korkové duby a olivovníky, na samém jihu pak banánovníky, pomerančovníky a cukrová třtina.
Na Madeiře roste mnoho endemických druhů dřevin a květin:cykasy, prothea, vavříny apod. Symbolem ostrova jsou strelície, které rostou téměř všuce. některé druhy orchidejí jsou tu považovány za plevel. Podél silnic rostou květiny, které u nás uvidíte v květinářství. Ve vnitrozemí ostrova se rozkládá třetihorní prales Laurissilva, který byl díky své vyjímečnosti zapsán na seznam světového dědictví UNESCO. Rostou v něm například ojedinělé druhy vavřínu.

Korkový dub – Quercus suber

Při projíždění provincií Alentejo spatříte tisíce korkových dubů pokrývající svahy kopců. Korkový strom je vysoký, má lesklé, zelené listy, hrbolatá kůra se na mnoha místech odlupuje. Korek je jeden z nejvýhodnějších surovin pro Portugalsko. Vyrůstá téměř po celé zemi a zásobuje se jím přes 700 továren na zpracování jeho dřeva. Světová produkce kúry se pohybuje okolo 320 000 tun ročně, z toho více než 50 % se nasbírá v Portugalsku.
Korkový dub má schopnost regenerovat svoji kúru. Umožňuje tak její loupání bez toho, aby se strom poškodil. První loupání se může provádět po 25 letech, poté, co kmen dosáhne minimálně 70 cm v obvodu. Další sběry úrody korkové kúry se provádí po dalších 9 letech v letních měsících. Teprve při 3 sběru dosahuje kůra potřebné kvality. Korkový dub dosahuje stáří až 180 let, to znamená, že umožňuje minimálně 17-ti násobnou úrodu. Plantáže korkových dubů jsou přísně střežené a chráněné a kontrolované ministerstvem.
Každá buňka kúry obsahuje plyn podobný vzduchu, stěny buněk jsou tvořeny celulózou, suberinem a voskem. Přítomnost suberinu zamezuje propustnosti vody a plynu, což ve spojení s výborným vlastnostmi regenerace předurčuje korek jako ideální produkt pro uzávírání lahví.
Korkovník je žádán pro svou nízkou váhu, je jen pětkrát těžší než voda. Korek má velmi mnoho využití díky své váze a své univerzálnosti – používá se k výrobě podlahy, bot, košů, nosníků, rybářských splávků apod. V roce 1960 se přestal korek používat k uzavírání ginu a whisky, u levných vín nahradil korek plastikové uzávěry. Ale u kvalitních vín se stále používá korek. V likérkách se užívá 25 biliónů korkových uzávěrů ročně. Korek má přírodní vlastnosti – nevoní, nechutná a neobsahuje žádné toxické látky. Spotřeba korkových uzávěrů pro šampaňské činí 30 milionů uzávěrů denně, 500 miliónů ročně.

Eukalyptus

Eukalyptus potřebuje ke svému životu mnoho vody. Patří stejně jako korkový dub k výhodným produktům k obchodování. Roste poměrně rychle – 10 let trvá doby kdy se může kácet. Využívá se jeho dužina, která vynesla Portugalsku v 90. letech zhruba 2 miliony US za rok. Eukalypty vyrůstají téměř všuder na svazích hor, jsou nenáročné. Na účet rozrůstajícím se eukalyptům klesá počet olivovníků a korkových dubů. Vědci jsou ještě více skeptičtí, tvrdí totiž, že eukalypty berou půdě živiny, vysuščují ji a ničí přirozený život v přírodě.

Výrobky z eukalyptu pomáhají při léčbě astma, bronchitidě, infekce, horečky, angíny, revma, neuróze apod.